ذكر ذلك الأخ الدكتور مكنون لموقع الجامعة الإلكتروني بعد عودته من جمهورية السودان الشقيق مساء الأحد الماضي 16/8/2009م بعد زيارة استغرقت اثني عشر يوما زار خلالها عددا من الجامعات السودانية والتقى مدراءها وعمداءها ونخبة من الأساتذة والأكاديميين هناك ، وأوضح الأخ نائب رئيس الجامعة أن زيارته كانت ناجحة ومثمرة حيث تم خلالها التوقيع على عدد من اتفاقيات التعاون العلمي والثقافي بين جامعة الأحقاف وجامعتي الجزيرة والخرطوم  بهدف تعزيز التعاون في البرامج التربوية والعلمية والثقافية وتبادل الزيارات بين هيئة التدريس والإداريين لغرض التدريب وزيادة الخبرات والمعرفة لإقامة مشاريع بحثية مشتركة والتعاون في مجال الدراسات العليا والمشاركة في المؤتمرات العلمية والندوات وتبادل الخبرة في مجال المناهج والخطط الدراسية ونظم الإدارة الجامعية والاستعانة ببعض أعضاء هيئة التدريس في الجامعات السودانية للتدريس في جامعة الأحقاف .
هذا وتجدر الإشارة إلى أن جامعة الأحقاف كانت قد وقعت ثلاث اتفاقيات مماثلة بداية الفصل الدراسي الثاني من العام الدراسي المنصرم 2008/2009م مع ثلاث جامعات سودانية هي ( النيلين وأم درمان الإسلامية والقرآن الكريم والعلوم الإسلامية السودانية ) للأهداف نفسها .