تهدف المرحلة الأولى من المشروع إلى إزالة الخطر عن مبنى القصر وتصفية المخلفات المتراكمة من أسطح وغرف واروقة القصر وازالة الاشجار وتحسين حديقة القصر .
وأكد محافظ حضرموت قائد المنطقة العسكرية الثانية اللواء الركن فرج سالمين البحسني اهتمام السلطة المحلية بإعادة ترميم المواقع الأثرية بالمحافظة ومنها قصر السلطان القعيطي بالمكلا .
بدوره أوضح مدير الهيئة العامة للآثار والمتاحف د. أحمد هادي باحارثة أن المرحلة الأولى ستتبعها مرحلتين أخريتين تستهدف تدعيم الأسطح بالنورة والمادة الجيرية وإعادة تأهيل الشرفات والأبواب والنوافذ .
من جانبه اعرب مدير دائرة الاثار بالهيئة رياض باكرموم عن شكر الهيئة لقيادة السلطة المحلية بالمحافظة على سرعة تجاوبها وحرصها على حماية وصيانة المعالم التاريخية لمدينة المكلا ، وأضاف ان هذا المشروع بداية الانطلاقة لمزيد من المشاريع المستقبلية لحماية المعالم التاريخية والاثرية في حضرموت .
الجدير بالذكر ان القصر السلطان يضم حالياً متحف المكلا ومقر إدارة الهيئة العامة للآثار والمتاحف .